09.06.2014 територія фонду «ІЗОЛЯЦІЯ» була захоплена окупаційною адміністрацією м. Донецька, було проголошено, що захоплення здійснено для розміщення так званої «гуманітарної допомоги», що надходить з Росії, а також для інших потреб ДНР. 
Як зазначає Фонд на своєму сайті, так звана «ДНР»  одразу ж розмістила снайпера на верхівці терикону, що знаходиться на території культурного простору.
10.06.2014 зафіксовані факти мародерства та розграбування приміщень Фонду: злам сейфу та дверей у приміщення з дорогими інструментами та обладнанням, розкрадання речей, що належали Фонду і його співробітникам. Керівництвом простору «ІЗОЛЯЦІЯ» направлені звернення про кримінальне правопорушення на адресу Генеральної прокуратури, Служби Безпеки та Міністерства Внутрішніх Справ України, однак дії з їхньої сторони не вжито.

2.07.2014 на території заводу було створено спеціальний комітет самопроголошеної ДНР. Головою якого  був призначений Леонід Баранов. Останній в  інтерв'ю російським ЗМІ розповідав про те, що комітет здійснює слідчі та каральні функції. Крім того, повідомляється про базування на території заводу батальйону «Восток». З того часу в ЗМІ з'являється інформація про утримання на території заводу цивільних заручників, які переслідувалися окупаційними силамии. Звільнені з ДНР українські громадяни розповідають, що «Ізоляція» використовується як місце для незаконного позбавлення свободи, психологічного тиску та катування захоплених окупаційною адміністрацією громадян. 

Описані події розслідуються правоохоронними органами України. 29.10.2020 стало відомо, що Донецька обласна прокуратура спільно зі слідчим управлінням Головного управління Національної поліції  у Донецькій області заочно повідомили про підозру керівнику підпільної в’язниці «Ізоляція».  
У повідомленні зазначається, що досудовим розслідуванням встановлено, що у 2014-у озброєні представники незаконного воєнізованого формування так званого «Министерства государственной безопасности», що контролюється РФ, захопили територію колишнього заводу ізоляційних матеріалів, на захопленому підприємстві було облаштовано «катувальну базу», де незаконно утримували цивільних осіб, полонених військовослужбовців Збройних сил України. Слідство зазначає, що незаконно ув’язнених громадян годинами катували електричним струмом, били, тримали в нелюдських умовах без їжі та води і примушували до тяжкої праці.
За оприлюдненою Офісом Генерального прокурора в липні 2021 інформацією було  викрито та заочно повідомлено про підозру двом представникам незаконних збройних формувань – керівникам та організаторам підпільної в’язниці «Ізоляція».
За даними слідства, з 2014 мешканець смт Зуївка Донецької області, який раніше служив у французькому Іноземному Легіоні та брав участь у бойових діях в Сирії, зайняв посаду «керівника центру спецоперацій міністерства державної безпеки ДНР». Разом зі своїм заступником –- колишнім підприємцем за вказівкою кураторів з РФ вони організували у Донецьку на території колишнього заводу ізоляційних матеріалів підпільну в’язницю, де вчинялися тяжкі та особливо тяжкі злочини. 
Повідомляється, що слідством було викрито ключовий керівний склад незаконного місця позбавлення волі та основні виконавці злочинів, які там вчинялися. Загалом станом на 07 .07.2021 заочно повідомлено про підозру у порушенні законів та звичаїв війни на території «Ізоляції» 15 особам. Встановлено близько 170 постраждалих.
05.08.2022 прокурорами Офісу Генерального прокурора було передано до суду обвинувальний акт стосовно так званого керівника в’язниці «Ізоляція» на тимчасово окупованій території Донецької області. У повідомленні зазначається, що в’язницю було створено для незаконного утримання військовополонених і цивільних осіб, їх тортур, завдання каліцтва з метою отримання показань про начебто вчинення ними злочинів, а також залякування та здійснення на них психологічного тиску.
Означені події широко висвітлювалися в українських ЗМІ. Зокрема нелюдське поводження та катування в'язнів «Ізоляції» ставало предметом уваги багатьох журналістських видань. 
«Радіо Свобода» спільно з  «Bellingcat» за вказаними подіями провели своє розслідування та зняли відеоматеріал: «Найжорстокіше місце Європи: Як і чому комендант «Ізоляції» переїхав до Києва».